为了尽可能的避免佐渡一国再度形成割据，上杉清定不得不将谱代家臣和亲信家臣转封至佐渡一国，甚至还不设置佐渡守护代的役职。

而且，转封（国替）的目的是将组成大名（国人领主）军事力量的人从其各自的领地上连根拔起。

清定还对转封至越后的河原田贞兼、本间高信、泻上秀敏、久知时泰、泽根高秀等人说：“汝家中之人，武士自不用说，下至中间、小者，只要是奉公人就尽数带走，一人也不要留下！”

当然，对于坚决不走的人要即刻进行相关的惩处。同时也命令不得带走任何拥有田地、缴纳年贡并在检地账上登记为百姓的人。

转封其实是明确区分了兵、农，是兵农分离政策的一环。这些人在搬迁之时当然也要带上自己的妻子儿女。

毕竟这些人与越后上杉家转封至越中、佐渡两国的家臣不同，纯粹是外样家臣（外样国人领主）。

而转封至越中、佐渡两国的越后上杉家家臣大都是带着家臣、同族前去，自己的家眷子嗣会搬迁至颈城郡的府中町、春日町等地，作为人质。

佐渡之人称越后上杉家此举导致“诸侍一人不落，全被赶出其所熟居的乡里，有些还浪迹于佐州三郡的山野与女人身边，疲惫不堪，悲叹不已。”

而后，清定就着手开始对佐渡一国进行大规模的检地，以此来掌握佐渡三郡二十二乡的实际产出。

天文十二年，四月二十五日。

因佐渡一国的面积不大，加上有八千五百余越后上杉军的震慑下，在进行检地之时没有遇到任何阻力。

经过近一个月的检地后，佐渡三郡二十二乡的原指出检地为一万七千石，实际检地为两万一千石，石高差异为四千石。

清定为了尽可能的消除一向宗在佐渡一国的影响力，就下令将那些被一向宗法主本愿寺证如破门的一向宗寺院、道场等尽数拆毁，一座不留。还赦免参与佐渡一向一揆的领民，让他们改宗。就连被破门的一向宗僧人，也被清定勒令还俗，并分配至三郡之中的各处村落之中参与农事生产。

不仅如此，清定还对国分寺（杂太城南部）、渡津神社（度津神社、一宫八幡宫，主祭神为五十猛命，配神为大屋津姬命、抓津姬命）、大目神社、引田部神社、物部神社、大幡神社等佐渡一国的寺院神社进行修缮，并免除这些寺院神社一年的年贡。

另外，得以留在佐渡一国，并本领安堵的小国人领主们还特意献给清定五只朱鹮。

但清定并没有将这五只朱鹮就此据为己有，反而是派遣直江伊势松丸将朱鹮先送至越后府中，再由谱代家老柴田尾张守作为使者前去上洛，分别将两只朱鹮进献给朝廷、一只进献给足利义晴、一只赠予给本愿寺证如、一只赠予越前守护朝仓孝景。

毕竟朱鹮这种鸟类动物，对于清定来说是可有可无的，他眼下需要的是提升越后上杉家的财政收入，以及扩大领国范围和积蓄实力。

因为，越后上杉家迟早会与武田家、北条家治下的领国接壤，届时将不可避免的会陷入多线作战。正所谓打铁还需自身硬，只有自身的实力足够强大了，才有余力来应付之后的强敌。